这个故事发生在1926年的纽约。当时野鸡对魔法师的反抗达到了顶峰，玛丽露(萨曼莎莫顿饰)领导的反魔法组织活动频繁。与此同时，各种灾难和意外在街头时有发生，以至于魔法世界的存在距离曝光只有一线之隔，整个魔法部都处于前所未有的紧张气氛中。在这个节骨眼上，神奇的动物学家纽特(埃迪雷德梅恩埃迪雷德梅恩)来到了纽约。他周游世界研究神奇的动物。他随身携带的魔法皮箱里装着他一路上救助的几十只魔法动物，他的一举一动都受到魔法部前傲罗蒂娜(凯瑟琳沃特斯顿凯瑟琳沃特斯顿饰)的监督。在一次意外中，雅各布(丹福勒丹福勒饰)误拿了纽特的行李箱，释放了藏在行李箱里的神奇动物。为此，纽特、蒂娜、雅各布和蒂娜的妹妹奎尼(艾莉森苏多尔，Alison Sudor)不得不踏上寻找神奇动物的旅程。