银河共和国的克隆人军队正在与分离主义联盟的机器人军队作战。尤达派了极地学徒Yasukatano作为阿纳金的学徒加入克里斯托弗之战。杜库伯爵计划在塔图因绑架贾巴的小儿子。为了进入银河系的外围，绝地长老们派出阿纳金、亚苏卡和机器人R2在战斗结束后带领克隆人军队营救人质，而欧比-万肯诺比则前往塔图因星球的贾巴商讨联盟事宜。阿纳金一行在泰斯达的一座神庙里遇到了分离势力联盟的机器人军队和西斯武士阿萨基文崔斯。虽然他们救了贾巴的小儿子，但没想到更大的阴谋在等着他们。这部电影是唯一的电脑动画“星球大战”电影，也是华纳公司发行的“星球大战”系列中唯一的电影。