资深特工伊森亨特(汤姆克鲁斯饰)也有亲密时刻。在接到最新的任务时，他遭到了一个神秘财团的伏击，落入了对方的手中。辛迪加是由世界各地的前特工组成的秘密组织，之前一直被中情局认为毫无根据。在另一名成员伊莎福斯特(丽贝卡弗格森饰演的丽贝卡弗格森)的帮助下，伊森逃脱了，并迅速向威廉布拉德(杰里米雷纳饰演的杰里米雷纳)报告了这个犯罪集团的确切存在。然而，此时布拉德的生活并不轻松。他所在的IMF组织因为俄罗斯核弹头等事件，被中情局指控并勒令解散。当得知该组织密谋刺杀奥地利总统后，伊森联系老搭档班吉邓恩(西蒙佩格饰)采取行动，并再次遇到神秘女孩伊莎。在接下来的一系列事件中，辛迪加的真面目逐渐显露，他们终于暴露了自己的真实目的。