杰森伯恩事件引起连锁反应，踏脚石计划和中情局用毒品控制加强特工的做法通过报纸公之于众，让其幕后人员坐立不安。为了防止血本无归的局面，中情局高层决定暂停该计划，将相关特工和科学家从行动中清除出去。在接下来的日子里，深藏在国家政治底层，依靠蓝绿药丸执行各种绝密任务的特工们相继死去，而负责染脏双手的前美国空军上校埃里克贝尔(爱德华诺顿爱德华诺顿饰)则慢慢将屠刀伸向了隐藏在阿拉斯加深山雪山中的特工艾伦克劳斯(杰瑞米雷纳饰)。突然的炮火袭击让艾伦意识到了自己的危险处境。在接下来的日子里，他不仅要熬过昔日同伴的追逐，还要努力寻找为他提供源源不断体力和智力的蓝绿色药丸——豆瓣。